Университет Трех Ущелий был одобрен Министерством образования и был основан 25 мая 2000 года в результате слияния бывшего Уханьского университета гидравлики и электроэнергетики (Ичан) и бывшего Хубэйского университета трех ущелий. Предшественником первоначального Уханьского университета гидравлики и электроэнергетики (Ичан) был Гэчжоубинский гидроэнергетический колледж, основанный в 1978 году. Он последовательно входил в состав Министерства водных ресурсов и электроэнергетики, Министерства энергетики, Министерства электроэнергетики и Государственная электроэнергетическая компания. В 1996 году он объединился с бывшим Уханьским университетом водного хозяйства и электроэнергетики, образовав новый Уханьский университет водного хозяйства и электроэнергетики, который стал важной частью «211 проекта» строительных университетов. Бывший Хубэйский колледж «Три ущелья» был образован в 1996 году в результате слияния бывших Ичанской нормальной высшей и специальной школы, Ичанской медицинской высшей и специальной школы и Ичанского профессионального университета.

История университета берет свое начало в 1923 году, в 1978 году университет начал организовывать обучение по программам бакалавриата, что стало первой партией бакалавров в Китае, в 1996 году начал организовывать обучение по программам магистратуры, а в 1998 году начал подготовку докторантов. Университет является университетом первого класса и принимает студентов из 31 провинции, автономных районов, муниципалитетов, находящихся в непосредственном подчинении центрального правительства, и более чем 60 стран (регионов).

Университет имеет право присуждать докторские степени и обладает квалификацией, позволяющей рекомендовать выдающимся студентам учиться на степень магистра без экзаменов. Он имеет право набирать студентов подготовительной подготовки из числа этнических меньшинств, иностранных студентов в Китае, студентов, получивших стипендии правительства Китая（CSC）, а также иностранных студентов по специальностям клинической медицины (преподавание на английском языке). Может набирать студентов из Гонконга и Тайваня без экзаменов.

Университет был совместно создан Министерством водных ресурсов и Народным правительством провинции Хубэй и является университетом в «Программе отличного инженерного образования и подготовки» Министерства образования. В 2018 году школа была включена в список «первоклассных отечественных университетов строительства» Народным правительством провинции, а три дисциплины, включая инженерию водного хозяйства, гражданское строительство и электротехнику, были включены в список «первоклассных отечественных дисциплин строительства». В 2022 году дисциплина инженерии водного хозяйства была определена как первоклассная дисциплина культивирования и строительства для провинциальных университетов. В настоящее время Университет Трех Ущелий превратился в комплексный университет с очевидными характеристиками и преимуществами водопользования и электричества, сильной комплексной школьной мощью, высокой социальной репутацией и большим потенциалом развития.